Prey forteller historien om Tommy, en cherokee-indianer og mekaniker som sitter fast i et reservat der alt står stille. Sammen med stammen sin blir han bortført av et truende moderskip som går i bane rundt jorden, der han går i gang med å berge seg selv, kjæresten og til sist planeten sin.

• Forbedret motor:Motoren er en forbedret DOOM 3-motor, den mest imponerende 3-D-motoren brukt i et spill.
• Portalteknologi: Denne funksjonen gir spillet en ny dimensjon. Den gjør at fiender dukker opp i løse luften og skaper nye og helt originale gåter og spillestiler.
• Enestående stil: Spillet har støtte for flere spillere som drar fordel av enestående spillestiler og elementer, for eksempel Spirit Walking (Åndegange), Wall Walking (Veggange) og Deathwalk (Dødsgange).
• Åndelig hjelp: Tommy har en hjelper, en åndehauk som kan hjelpe ham i kampen mot fiender og tyde det fremmede språket til det levende skipet.